
Учреждение создано как областной онкологический диспансер на основании решения исполнительного комитета Челябинского областного Совета депутатов трудящихся от 12.10.1945 года № 975 «О мероприятиях по улучшению онкологической помощи населению».
На основании постановления главы администрации Центрального района города Челябинска от 10.07.1996 года № 1196-3 «О регистрации государственного лечебно-профилактического учреждения «Челябинский областной онкологический диспансер» зарегистрировано государственное лечебно-профилактическое учреждение «Челябинский областной онкологический диспансер».
На основании постановления Правительства Челябинской области (от 18.05.2006 года № 95-П «О реорганизации государственных учреждений здравоохранения путем присоединения») Государственное лечебно-профилактическое учреждение «Челябинский областной онкологический диспансер» реорганизовано путем присоединения к нему государственного учреждения здравоохранения «Областной онкологический диспансер № 4».
Государственное лечебно-профилактическое учреждение «Челябинский областной онкологический диспансер» является правопреемником прав и обязанностей государственного учреждения здравоохранения «Областной онкологический диспансер № 4».
На основании приказа Министерства здравоохранения Челябинской области от 23.04.2008 года № 307 «О присвоении Государственному лечебно-профилактическому учреждению «Челябинский областной онкологический диспансер» статуса клинического учреждения и об утверждении изменений № 2 к уставу Государственного лечебно-профилактического учреждения «Челябинский областной онкологический диспансер» Государственному лечебно-профилактическому учреждению «Челябинский областной онкологический диспансер» присвоен статус клинического учреждения, учреждение переименовано в Государственное лечебно-профилактическое учреждение «Челябинский областной клинический онкологический диспансер».
На основании приказа Министерства здравоохранения Челябинской области от 09.08.2011 года № 1037 «Об утверждении изменений № 4 к уставу Государственного лечебно-профилактического учреждения «Челябинский областной клинический онкологический диспансер» Государственное лечебно-профилактическое учреждение «Челябинский областной клинический онкологический диспансер» переименовано в Государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Челябинский областной клинический онкологический диспансер».
На основании распоряжения Правительства Челябинской области от 30.01.2017 года № 28-рп «О переименовании учреждения здравоохранения» Государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Челябинский областной клинический онкологический диспансер» переименован в Государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Челябинский областной клинический центр онкологии и ядерной медицины».
На основании распоряжения Правительства Челябинской области № 696-рп от 14.09.2020 г. «О реорганизации государственных учреждений здравоохранения Челябинской области в форме присоединения» Государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Челябинский областной клинический центр онкологии и ядерной медицины» реорганизовано путем присоединения к нему Государственного бюджетного учреждения здравоохранения «Областной онкологический диспансер № 3».
Государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Челябинский областной клинический центр онкологии и ядерной медицины» является правопреемником прав и обязанностей Государственного бюджетного учреждения здравоохранения «Областной онкологический диспансер № 3».
Государственное автономное учреждение здравоохранения «Челябинский областной клинический центр онкологии и ядерной медицины» создано на основании распоряжения Правительства Челябинской области от 07.04.2022 № 254-рп «О создании государственного автономного учреждения «Челябинский областной клинический центр онкологии и ядерной медицины» путем изменения типа существующего Государственного бюджетного учреждения здравоохранения «Челябинский областной клинический центр онкологии и ядерной медицины».